Výuku fyziky nelze provádět bez laboratorních cvičení. Z toho důvodu udržujeme šest specializovaných výukových laboratoří: Laboratoř atomové a jaderné fyziky Laboratoř elektřiny, magnetizmu a elektroniky Laboratoř mechaniky Laboratoř nanotechnologií Laboratoř termodynamiky a molekulové fyziky Laboratoř školních pokusů